A fehérhátú fakopáncs elsődleges élőhelyéül azok a természeteshez közeli lombos, vagy lombelegyes erdők szolgálnak, amelyekben a természeti folyamatok többnyire még működőképesek. Az ilyen erdők, ahol az öreg és holtfák mennyisége a maguk természetes arányában van jelen, hazánkban csak nagyon kis kiterjedésben léteznek. Magyarországon legfontosabb élőhelyét elsősorban az idős, holtfában gazdag bükkösök  képezik. Kisebb mértékben a bükkösök között húzódó patakvölgyek égereseiben és a bükkösökkel határos gyertyános tölgyesekben is megtelepszik. Az állandó vagy időszakos patakmedrek vízben fekvő vagy csak nedves faanyaga hazánkban is az élőhely kedvelt szerkezeti eleme. Különösen fontos számára a vékonyabb, korhadt, elhaltgombás, széltörést szenvedett fák nagyszámban való jelenléte, mert csak ezekből tud táplálékot gyűjteni, illetve odúját is ezekbe vési.